Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
APEX2Q9UBZ4 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
APEX2Q9UBZ4 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms