Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBD3

XCL2, Cytokine SCM-1 beta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XCL2Q9UBD3 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
XCL2Q9UBD3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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