Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CHMP5Q9NZZ3 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CHMP5Q9NZZ3 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms