Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZDHHC3Q9NYG2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZDHHC3Q9NYG2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms