Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX08

COMMD8, COMM domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD8Q9NX08 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
COMMD8Q9NX08 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
COMMD8Q9NX08 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms