Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVU0

POLR3E, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3EQ9NVU0 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
POLR3EQ9NVU0 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
POLR3EQ9NVU0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms