Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GJB4Q9NTQ9 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GJB4Q9NTQ9 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms