Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CENPMQ9NSP4 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms