Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD9

FARSB, Phenylalanine--tRNA ligase beta subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FARSBQ9NSD9 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
FARSBQ9NSD9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
FARSBQ9NSD9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms