Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TM7SF3Q9NS93 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TM7SF3Q9NS93 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms