Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNNM1Q9NRU3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNNM1Q9NRU3 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNNM1Q9NRU3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms