Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CD163L1Q9NR16 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CD163L1Q9NR16 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms