Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SEC31BQ9NQW1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SEC31BQ9NQW1 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms