Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQS7

INCENP, Inner centromere protein, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INCENPQ9NQS7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
INCENPQ9NQS7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
INCENPQ9NQS7 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
INCENPQ9NQS7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms