Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ABCB9Q9NP78 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms