Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZCCHC17Q9NP64 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ZCCHC17Q9NP64 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms