Protein–RNA interactions for Protein: Q9HDB9

ERVK-5, Endogenous retrovirus group K member 5 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-5Q9HDB9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVK-5Q9HDB9 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVK-5Q9HDB9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVK-5Q9HDB9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVK-5Q9HDB9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ERVK-5Q9HDB9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVK-5Q9HDB9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms