Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TMEM8AQ9HCN3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TMEM8AQ9HCN3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms