Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAS3

SLC28A3, Solute carrier family 28 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A3Q9HAS3 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC28A3Q9HAS3 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SLC28A3Q9HAS3 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms