Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7U1

CCSER2, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER2Q9H7U1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCSER2Q9H7U1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCSER2Q9H7U1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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