Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PRDM12Q9H4Q4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms