Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CLSTN2Q9H4D0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CLSTN2Q9H4D0 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms