Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
HIPK3Q9H422 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIPK3Q9H422 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIPK3Q9H422 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIPK3Q9H422 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
HIPK3Q9H422 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIPK3Q9H422 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIPK3Q9H422 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIPK3Q9H422 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HIPK3Q9H422 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms