Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDCL3Q9H2J4 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDCL3Q9H2J4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms