Protein–RNA interactions for Protein: Q9C037

TRIM4, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM4, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM4Q9C037 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TRIM4Q9C037 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms