Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXQ1Q9C009 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
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