Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CRNKL1Q9BZJ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CRNKL1Q9BZJ0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms