Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PUS3Q9BZE2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PUS3Q9BZE2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms