Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ4

KRTAP9-2, Keratin-associated protein 9-2, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-2Q9BYQ4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-2Q9BYQ4 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-2Q9BYQ4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
KRTAP9-2Q9BYQ4 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.76
KRTAP9-2Q9BYQ4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 CCL20-202ENST00000409189 839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 USP9YP28-201ENST00000435142 589 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 VN1R110P-201ENST00000438988 971 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 WT1-AS-206ENST00000525436 1254 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 NOVA1-209ENST00000547619 947 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP001505.1-201ENST00000569966 824 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AF230666.2-201ENST00000602328 725 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC006511.2-201ENST00000388966 660 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC007919.2-201ENST00000444110 511 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 MTND3P4-201ENST00000453537 303 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 IFNA5-201ENST00000610521 987 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC090506.2-201ENST00000624521 419 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 KCNIP4-204ENST00000382150 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
KRTAP9-2Q9BYQ4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms