Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG3

NIFK, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIFKQ9BYG3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
NIFKQ9BYG3 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
NIFKQ9BYG3 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms