Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SCAPERQ9BY12 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
SCAPERQ9BY12 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms