Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC94Q9BW85 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC94Q9BW85 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms