Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUZ4

TRAF4, TNF receptor-associated factor 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF4Q9BUZ4 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF4Q9BUZ4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF4Q9BUZ4 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
TRAF4Q9BUZ4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRAF4Q9BUZ4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms