Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
HERPUD2Q9BSE4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.31■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
HERPUD2Q9BSE4 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
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