Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM79Q9BSE2 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM79Q9BSE2 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM79Q9BSE2 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM79Q9BSE2 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM79Q9BSE2 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM79Q9BSE2 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM79Q9BSE2 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM79Q9BSE2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM79Q9BSE2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM79Q9BSE2 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
TMEM79Q9BSE2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
TMEM79Q9BSE2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
TMEM79Q9BSE2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TMEM79Q9BSE2 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms