Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
DUSP9Q99956 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
DUSP9Q99956 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms