Protein–RNA interactions for Protein: Q99457

NAP1L3, Nucleosome assembly protein 1-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L3Q99457 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NAP1L3Q99457 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms