Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CSRNP1Q96S65 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CSRNP1Q96S65 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms