Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ALS2Q96Q42 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ALS2Q96Q42 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms