Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SMG1Q96Q15 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SMG1Q96Q15 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
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