Protein–RNA interactions for Protein: Q96PV0

SYNGAP1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGAP1Q96PV0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SYNGAP1Q96PV0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SYNGAP1Q96PV0 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms