Protein–RNA interactions for Protein: Q96P69

GPR78, G-protein coupled receptor 78, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR78Q96P69 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR78Q96P69 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR78Q96P69 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR78Q96P69 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR78Q96P69 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR78Q96P69 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR78Q96P69 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR78Q96P69 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR78Q96P69 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR78Q96P69 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR78Q96P69 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR78Q96P69 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR78Q96P69 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR78Q96P69 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR78Q96P69 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
GPR78Q96P69 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
GPR78Q96P69 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms