Protein–RNA interactions for Protein: Q96NU1

SAMD11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD11Q96NU1 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SAMD11Q96NU1 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SAMD11Q96NU1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms