Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC43Q96MW1 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC43Q96MW1 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms