Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU8

KREMEN1, Kremen protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KREMEN1Q96MU8 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KREMEN1Q96MU8 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KREMEN1Q96MU8 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms