Protein–RNA interactions for Protein: Q96LB9

PGLYRP3, Peptidoglycan recognition protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP3Q96LB9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGLYRP3Q96LB9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGLYRP3Q96LB9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGLYRP3Q96LB9 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGLYRP3Q96LB9 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGLYRP3Q96LB9 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGLYRP3Q96LB9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGLYRP3Q96LB9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PGLYRP3Q96LB9 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PGLYRP3Q96LB9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms