Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ALPK3Q96L96 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ALPK3Q96L96 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms