Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SNX27Q96L92 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SNX27Q96L92 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms