Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MS4A4AQ96JQ5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MS4A4AQ96JQ5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms