Protein–RNA interactions for Protein: Q96JH7

VCPIP1, Deubiquitinating protein VCIP135, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCPIP1Q96JH7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
VCPIP1Q96JH7 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
VCPIP1Q96JH7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms